Het microbioom van COPD-patiënten

De chronische longziekte COPD (Chronic Obstructive Pulmonary Disease) kenmerkt zich door een toename van kortademigheid, hoesten en slijmvorming en is een veelvoorkomende ziekte in Nederland. Momenteel zijn er therapieën beschikbaar, waaronder het voorschrijven van een lage onderhoudsdosis Azitromycine, die ervoor zorgt dat het aantal longaanvallen drastisch daalt.
De samenstelling van de microbiële populatie (het microbioom) in deze patiëntenpopulatie speelt een belangrijke rol in het ziekteverloop. Microvida analyseert COPD-patiëntmonsters voor het Amphia met behulp van klassieke kweektechnieken en wil nu haar dienstverlening graag uitbreiden. Nieuwe innovatieve ‘next-generation sequencing’ (NGS) maakt het mogelijk om het volledige microbioom van deze patiëntenpopulatie snel en gedetailleerd in kaart te brengen zonder kweek vooraf.
Binnen dit project gaan we met een driehoek van MKB-, kennis- en praktijkpartners een high-throughput methode opzetten die het mogelijk maakt het microbioom in sputum snel en gebruiksvriendelijk te analyseren binnen deze patiëntenpopulatie. In het Amphia ziekenhuis loopt momenteel een klinische trial die het veilig afbouwen van het antibioticum Azitromycine onderzoekt en waarbij sputum samples verzameld worden. Met deze samples wordt in dit project een methode opgezet voor het isoleren van zuiver genetisch materiaal alvorens deze samples met behulp van NGS-technieken geanalyseerd worden. Als laatste stap zal een gebruikersinterface ontwikkeld worden die het mogelijk maakt om de verkregen data gebruiksvriendelijk te interpreteren en de resultaten te beoordelen. Alles met uiteindelijke doel meer kennis te vergaren over de samenstelling van het microbioom in relatie tot ziekte en gezondheid van de COPD-patiënt.